Repozytorium
Wyszukaj
Kolekcje
Inne
Hydrogen–deuterium exchange in imidazole as a tool for studying histidine phosphorylation.
Autorzy
Rok wydania
2014
Czasopismo
Analytical and Bioanalytical Chemistry
Numer woluminu
406
Strony
8013-8020
DOI
10.1007/s00216-014-8218-5
Kolekcja
Język
Angielski
Typ publikacji
Artykuł
Streszczenie
Isotope exchange at the histidine C2 atom of imidazole in D2O solution is well known to occur at a significantly slower rate than the exchange of amide protons. Analysis of the kinetics of this isotope-exchange reaction is proposed herein as a method of detecting histidine phosphorylation. This modification of His-containing peptides is challenging to pinpoint because of its instability under acidic conditions as well as during CID-MS analysis. In this work, we investigated the effect of phosphorylation of the histidine side chain in peptides on deuterium–hydrogen exchange (DHX) in the imidazole. The results demonstrate that phosphorylation dramatically slows the rate of the DHX reaction. This phenomenon can be applied to detect phosphorylation of peptides at the histidine residue (e.g., in enzymatic digests). We also found that the influence of the peptide sequence on the exchange kinetics is relatively small. A CID fragmentation experiment revealed that there was no detectable hydrogen scrambling in peptides deuterated at C2 of the imidazole ring. Therefore, MS/MS can be used to directly identify the locations of deuterium ions incorporated into peptides containing multiple histidine moieties.
Słowa kluczowe
Phosphohistidine, Hydrogen–deuterium exchange (HDX) reaction, Deuterium–hydrogen exchange (DHX) reaction, Mass spectrometry
Licencja otwartego dostępu
Licencja na prawach której można swobodnie kopiować, rozprowadzać, zmieniać i remiksować objęty prawem autorskim utwór (Utwór-przedmiot prawa autorskiego) pod warunkiem podania imienia i nazwiska autora utworu pierwotnego oraz źródła pochodzenia utworu.
Pełny tekst licencji: https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/pl/legalcode
Adres publiczny
http://dx.doi.org/10.1007/s00216-014-8218-5
Strona internetowa wydawcy
Podobne publikacje
Wymiana izotopowa wodór-deuter jako metoda otrzymywania standardów znakowanych izotopowo związków chemicznych do analizy ilościowej metodą LC-MS
Grocholska Paulina, Bąchor Remigiusz
Preparation of isotopically labelled standarts of creatinine via H/D exchange and their application in quantitative analysis by LC-MS.
Bąchor Remigiusz, Konieczny Andrzej, Szewczuk Zbigniew
Pressure as a denaturing agent in studies of single-point mutants of an amyloidogenic protein human cystatin C.
Jankowska Elżbieta, Stefanowicz Piotr, Sosnowska M., Karpowicz Przemysław, Radziszewska Karolina , Szewczuk Zbigniew, Szymańska Aneta